CRISPR基因编辑为罕见病、神经退行性疾病的根治带来了全新可能,但脱靶安全风险始终是管线IND申报、临床推进与商业化的最大卡点。2026年4月,美国FDA更新基因治疗基因组编辑安全评估指导原则,大幅收紧脱靶检测合规门槛,传统检测方法全面失效、不再被监管认可。行业合规洗牌之下,INDUCE-seq原位双链断裂检测技术凭借全维度适配FDA新政、细胞原位真实检测、无偏全基因组精准筛查的核心优势,成为目前基因编辑临床前安全评估的唯一刚需合规方案。
1 监管大变局:传统脱靶检测彻底“不合规”
新版FDA指导原则从检测场景、实验设计、细胞模型、数据质控六大维度,明确了临床申报硬性标准,核心要求可总结为:必须活细胞原位检测、必须多重重复验证、必须量化真实编辑频率、必须规避扩增偏差。
此前行业通用方案已无法满足申报要求,存在致命短板:
Ø 生物信息预测(Cas-OFFinder):仅靠序列比对,无实验实证,无法适配真实染色质环境,仅能做初步参考,不具备申报效力;
Ø 无细胞检测(CHANGE-seq等):以裸露DNA为底物,脱离活细胞生理环境,假阳性海量爆发,数据失真、无法代表体内真实编辑状态,禁止单独用于IND申报。
大量药企与科研团队因此面临申报驳回、管线延期、数据重做的困境,行业亟需一套精准、合规、可落地的标准化检测体系。
2 核心技术优势:INDUCE-seq全方位领跑行业
作为当前唯一完全契合2026 FDA基因编辑安全新标准的技术,INDUCE-seq彻底打破传统技术局限,为临床级基因编辑安全质控提供标准化解决方案。
ü 活细胞原位检测,还原真实编辑场景
摒弃体外裸DNA检测,直接在完整生理染色质环境下,原位捕获CRISPR引发的全基因组双链断裂事件,真实复刻人体细胞编辑状态,从根源解决“体外数据与体内实况不符”的痛点,数据临床参考价值拉满。
ü 无PCR扩增,零偏差全基因组筛查
采用无扩增建库策略,彻底规避PCR偏好性偏差,不预设候选位点,实现全基因组无死角扫描,可精准捕捉常规方法遗漏的未知脱靶位点,完全匹配FDA无偏检测要求。
ü 标准化实验体系,直接适配IND申报
原生支持多重生物学重复+专属阴性对照体系,可精准区分编辑特异性断裂与细胞背景损伤;配套成熟统计模型,可完成脱靶定位、频率量化、风险分级全流程分析,输出监管认可的标准化数据。
ü 多模型适配,覆盖全研发场景
兼容患者iPSCs、原代细胞、疾病特异性模型等各类临床相关细胞,无需额外科学论证,适配神经退行性疾病、罕见遗传病等所有基因编辑研发项目。
3 顶刊论文实证:精准性获高分研究背书
INDUCE-seq的硬核实力,已在Olubankole等人2026年在《Molecular Therapy》发表的最新文章中得到充分验证。
该研究对120组双gRNA编辑体系开展安全性评估:传统Cas-OFFinder+CHANGE-seq组合累计筛出超5000个潜在脱靶位点,假阳性泛滥、有效信息极低;而INDUCE-seq仅锁定1个真实功能性脱靶位点,结果与300×超高深度WGS金标准完全吻合。
同时,INDUCE-seq技术可精准区分野生型与突变型等位基因的编辑差异,高效筛选出高安全、高效率的最优gRNA配对,大幅提升靶点筛选效率与临床转化可信度。
4 落地价值:加速管线合规商业化
在监管升级的行业趋势下,INDUCE-seq成为基因编辑管线从科研走向临床的核心抓手,落地价值清晰可见:
ü 规避申报风险:全流程契合FDA新规,彻底杜绝数据不合规导致的申报失败、管线延期;
ü 降本增效:单次检测完成全基因组筛查与风险验证,无需多平台交叉复盘,大幅缩短研发周期、降低试错成本;
ü 提升管线价值:监管级精准安全数据,夯实临床可信度,提升投融资与商业化核心竞争力。
目前,INDUCE-seq已成功应用于神经退行性疾病、罕见遗传病等多个前沿赛道的基因编辑研发项目,依托Broken String Biosciences的专业技术支撑,可为全球科研机构、药企提供定制化检测服务,覆盖靶点筛选、安全性评估、临床申报全流程。在基因治疗产业化加速的时代,选择合规、精准、高效的安全检测技术,就是选择管线研发的确定性与竞争力。
Broken String Biosciences是英国卡迪夫大学的衍生公司,致力于帮助基因编辑团队加快更安全、更有效的基因药物的开发。其成功开发出的一种高灵敏度、全基因组范围的DNA双链断裂检测新方法——INDUCE-seq®,不仅可精准识别基因编辑工具在预设靶位点诱导的双链断裂,还可系统性捕获其在基因组非靶向区域引发的脱靶断裂事件。目前,Broken String Biosciences已与全球多家基因编辑企业建立战略合作,为其提供早期、全面的编辑效应评估服务,从而助力提升产品安全性评价的科学性与可靠性,加速从临床前研究向临床应用的转化进程。本技术的核心使命在于增强基因编辑过程的可预测性与可控性,推动基因编辑技术向安全、有效、可监管的临床治疗方案稳健发展。
北京西美杰科技有限公司是Broken
String Biosciences中国一级代理,始终秉承着专业、严谨的态度为客户提供优质的产品与服务。如您对上述产品感兴趣欢迎拨打西美杰客服热线400-050-4006或登录网站www.xmjsci.com了解更多信息。
参考文献:
Arrayed dual-gRNA CRISPR screening platform for C9orf72 repeat expansion excision in patient iPSCs. Molecular Therapy: Advances Vol. 34 June 2026.
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